Memasuki tahun ajaran baru 2016/2017, Pondok Pesantren Fathan Mubina menerima sekitar 196 santri baru yang terdiri dari 150 santri Kelas I SMP putra dan putri, serta 46 santri kelas I’dadi (kelas intensif) putra dan putri. Pada tanggal 20 Juli 2016, para santri baru serentak datang dari berbagai daerah masing – masing mulai dari Sabang sampai Marauke. Pada saat baru pertama kali datang ke pondok, santri baru harus beradaptasi dahulu dengan mengenal pondok, lingkungan, aturan, serta segala sesuatu tentang Pondok Pesantren Fathan Mubina. Maka dari itu, dilaksanakanlah kegiatan Masta’ari (Masa Ta’aruf Santri) atau biasa dikenal dengan Masa Orientasi Siswa (MOS).
Masta’ari dilaksanakan selama empat hari mulai tanggal 21 – 24 Juli 2016, yang diisi dengan berbagai kegiatan mulai dari pemberian materi pengenalan Pondok Pesantren Fathan Mubina, serta yang paling disukai oleh para santri baru yaitu games-games interaktif serta Outbond. Kegiatan – kegiatan tersebut selain ditujukan untuk mengenalkan Fathan Mubina kepada para santri baru, juga bertujuan untuk memberikan kesan yang menyenangkan kepada mereka pada masa awal mereka ‘nyantri.’
Sebagai bentuk peresmian santri baru 2016, maka pada hari terakhir Masta’ari, dilakukan penyematan secara simbolis kepada santri baru yang diberikan langsung oleh Bapak Pimpinan Pondok, H. Chairuman Kamal, MA, yang dilanjutkan dengan pembacaan ikrar santri yang diikuti oleh seluruh santri baru. Dengan penyematan dan pembacaan ikrar ini, maka telah resmilah mereka menjadi santri Fathan Mubina.
